由于研究所在生物肥料及酶制劑研究與開發領域取得了先進成果，國家科技部和外經貿委聯合委托河北省微生物所承辦了八屆生物肥料國際培訓班和一屆生物酶制劑培訓班，共接待和培訓了60多個國家的270多名學員。國際培訓項目的實施，加強了我們與國外同行的交流，擴大了研究所技術產品的影響力，促進了研究水平的提高，開創了研究所國際合作的新領域。
到目前為止，研究所分別與俄羅斯科學院西伯利亞分院細胞與遺傳研究所、白俄羅斯農業科學院、波蘭什切青農業大學、捷克南勃荷米亞大學、泰國清邁大學、泰國布拉帕大學、印度旁澤普大學就食藥用真菌、皮革工業用酶制劑、生物肥料等項目開展合作交流與技術合作，我方已多次派出專家組執行多項中外政府間國際合作項目。2003年研究所申報的國際重大合作項目“皮革加工用酶及其電子束輻射處理技術的研究與應用”獲得國家科技部的正式批準，目前研究所的科研人員正以嚴謹的科學態度就項目開展各項試驗與研究。
